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服务概述

蛋白质是生命功能的直接行使者。定量蛋白质组服务基于高分辨率电喷雾 Orbitrap 及 4D-timsTOF 质谱平台,提供对样本中复杂蛋白质组的精确定量。特别适合生物标志物筛选、药物理念验证及信号网络解析。

服务模块规格

1. DIA (数据非依赖采集) 组学:具有极佳的测量重现性,无缺失值,适于大规模样本分析。

2. TMT (串联质谱标记) / iTRAQ 定量:支持最多达 16 个平行样本的同时标记同针质谱检测。

3. 修饰蛋白质组 (PTMs):提供特异抗体富集平台,包含磷酸化、乙酰化、泛素化及糖基化修饰定量。

定量蛋白质组分析交付高重现性的表达矩阵、火山图、聚类热图以及功能富集通路图。

技术指标 服务参数与交付
主要仪器 高分辨率 Orbitrap 轨道阱质谱仪 / 4D timsTOF 质谱仪
检出深度 DIA 单针可稳定比对 8000+ 种蛋白质种类
微量建库 针对临床针吸穿刺活检组织开发了极微量蛋白质提纯系统
生信深度分析 火山图、通路聚类热图、蛋白相互作用网络 (PPI)、多组学关联通路富集
表 1. 定量蛋白质组主要技术参数与交付标准
Nature Communications IF: 16.6 发表时间: 2024
基于高通量 DIA 蛋白质组学揭示结直肠癌转移的血浆蛋白标志物与分子亚型
研究背景:早期结直肠癌极易发生远端转移,常规筛查缺乏高灵敏度的循环标志物。
研究方法:收集 120 例结直肠癌转移组、未转移组及健康人血浆,利用超高压液相色谱 (UPLC) 联用 Orbitrap 质谱仪进行无标定量 DIA 蛋白质组测序。
主要结论:鉴定出包含 8000 多种血浆蛋白质的高深度谱图。通过差异分析与机器学习筛选,锁定了一个由 4 个核心分泌蛋白组成的标志物面板(AUC=0.91),并解析了转移相关的粘附通路异常。

蛋白质提取及前处理对样品质量要求较高,送样时请确保符合以下参数:

样品类型 数量要求 提取/前处理建议 运输形式
新鲜动植物组织 动物组织 > 50mg, 植物组织 > 100mg 液氮速冻,切忌反复冻融 超低温干冰密封运输
细胞沉淀 ≥ 1 × 10^7 细胞 去除培养液,PBS洗涤,离心去上清,液氮速冻 超低温干冰密封运输
血清 / 血浆 ≥ 200 µL / 样本 离心去除红细胞,避免溶血 超低温干冰密封运输
穿刺组织 (微量) 3-5 条穿刺针芯 迅速置于超低温冷冻管中速冻 超低温干冰密封运输

服务概述

代谢物作为生理反应的终产物,能更灵敏、直接地映射外界环境刺激或体内突变对表型产生的扰动。HST GENOMICS 结合先进的液相色谱质谱 (LC-MS) 联用技术,提供覆盖数百至上千种代谢物的系统分析。

服务模块类别

1. 非靶向代谢组学 (Untargeted):无偏获取样本全谱代谢物变动,最适于生物发现与早期诊断标记建立。

2. 高灵敏靶向定量:针对胆汁酸、氨基酸、短链脂肪酸等核心通路小分子进行标准品校准的精确绝对定量。

3. 脂质组学与代谢流:深度覆盖甘油三酯、磷脂等极性/非极性分子,并支持同位素示踪分析。

代谢组分析交付定性定量分值表、多元统计图表(PCA, OPLS-DA)、VIP重要性图及通路富集图。

分析项目 交付图表/模型 主要技术用途
物质定性鉴定 二级碎片比对分值表、高分辨率精确分子量 准确识别内源及外源性小分子代谢物
多元统计分析 PCA 散点图、PLS-DA/OPLS-DA 判别分析 评估样本总体差异和组间分离趋势
标志物筛选 VIP 值百分比图、火山图 锁定对组间分类贡献最大的显著差异代谢物
通路映射 KEGG 代谢通路气泡图、通路关联网络 串联差异小分子与上游基因/蛋白的调控网
表 2. 代谢组定量分析主要交付物及统计模型
Cell Metabolism IF: 27.7 发表时间: 2024
肠道微生物代谢物短链脂肪酸调控宿主肥胖与胰岛素抵抗的靶向代谢组机制
研究背景:饮食结构的改变显著影响宿主代谢,但具体的小分子介导机制尚未完全探明。
研究方法:针对高脂饮食和正常饮食小鼠的粪便、盲肠内容物及外周血进行基于 LC-MS/MS 的非靶向代谢组与高灵敏靶向代谢物分析。
主要结论:非靶向代谢组筛选出数百种组间显著差异的小分子,随后靶向检测发现乙酸、丙酸等短链脂肪酸(SCFAs)在健康对照中显著富集。机制表明其通过激活肠道 GPR41/43 受体调节胰高血糖素样肽的释放,改善了外周组织的胰岛素敏感性。

代谢物稳定性较弱且易受外界污染,请严格遵守以下送样标准:

样品类型 数量要求 提取/前处理建议 运输形式
血浆 / 血清 ≥ 100 µL / 样本 收集后立即离心去细胞,避免溶血,速冻 超低温干冰密封运输
尿液 / 脑脊液 ≥ 200 µL / 样本 离心去除细胞碎片,迅速冻存 超低温干冰密封运输
动植物组织 ≥ 100 mg 冰上迅速剥离,PBS洗涤,液氮速冻 超低温干冰密封运输
粪便 / 肠道内容物 ≥ 100 mg 收集于无菌冻存管中,迅速投入液氮或-80℃ 超低温干冰密封运输