区间覆盖统计

对 A 中每条区间给出四个数：与它重叠的 B 条数、被 B 覆盖的碱基数（多条 B 重叠的部分只算一次）、A 的长度、覆盖比例（碱基数 ÷ 长度）。

例如 A 为基因、B 为变异时，第一列就是每个基因内的变异数；A 为固定窗口、B 为峰时，可看峰在基因组上的分布。

可要求同链或反链，或设最小重叠比例，只统计重叠足够多的 B。

覆盖比例保留 7 位小数（单精度），与常用命令行工具的输出一致；「B 条数最多的 20 条 A」便于快速找热点。

方法说明

输出列与数值格式与 BEDTools coverage 默认输出一致（Quinlan & Hall 2010, Bioinformatics 26:841），已在相同输入上逐行核对。

数据量

在浏览器中处理；建议每个文件不超过约 50 MB。