窗口切分与计数

把每条染色体从 0 开始按「窗口大小」切开，最后一个窗口截到染色体末端；步长小于窗口时得到相互重叠的滑动窗口。

提供要计数的区间后，每个窗口给出：重叠的区间条数、被覆盖碱基数、窗口长度与覆盖比例；折线图沿基因组显示每个窗口的条数，可找变异或峰富集的区段。

切分对象选「每个 BED 区域」时，在每个区域内部切窗口（如把基因体等分为固定长度的小段）。

窗口坐标为 BED 约定（0 起始、终点不含），可直接用于其他区间工具。

方法说明

窗口切分规则与 BEDTools makewindows（-w/-s/-i）一致，计数等同 intersect -c / coverage（Quinlan & Hall 2010, Bioinformatics 26:841），已在相同输入上逐行核对。

数据量

最多 500,000 个窗口；在浏览器中处理。