差异与检验 / 相关性分析
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Pearson 相关衡量线性关系,对极端值敏感;Spearman 与 Kendall 基于秩,衡量单调关系,对极端值和非正态更稳健。
只给一个表时计算所勾选变量两两之间的相关;再给第二个表时计算两表变量之间的相关(如基因表达与代谢物、物种丰度与环境因子)。
每对变量使用两者都不缺失的样本(成对删除)。P 值对全部变量对做多重检验校正;Pearson 另给出基于 Fisher z 变换的置信区间。
热图颜色为相关系数(红正蓝负),可选择把不显著的格子留空。相关不代表因果,样本量小时相关系数很不稳定。
Pearson、Spearman 系数及 P 值与 scipy.stats.pearsonr / spearmanr 一致,Kendall tau-b 与 scipy.stats.kendalltau 一致;Pearson 置信区间为 Fisher z 变换;校正与 R p.adjust 一致。
最多 50,000 行;变量对很多时(如数百个变量)计算会较慢。