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功能富集 / 富集差异气泡图

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怎么读

富集差异气泡图

横轴是比较组(如上调 / 下调基因,或不同处理、时间点),纵轴是富集条目;气泡越大,基因比例(或基因数)越高;颜色越深,P 值越小。

每个比较组取 P < 阈值的前 N 条,合并后作图;条目按「最显著的比较组」分块,再按 P 排序,便于看出各组特有和共有的通路。

默认把其他比较组中同一条目不显著的格子也画出来(浅色小气泡),便于对比;取消勾选则只画显著的格子。

作图不重新计算富集,只展示您结果表中的数值。

方法说明

颜色 = −log10(P),气泡面积随基因比例(k/n 按 k ÷ n 换算)或基因数增大。示例基因集:Liberzon A. 等 (2015) Cell Systems 1:417–425。

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