FASTQ 质量统计

逐位置质量图给出每个位置的均值、中位数、四分位（Q1/Q3）与 10%/90% 分位（P10/P90）；Illumina 数据通常在读段末端下降，中位数长期低于 20 的区段建议修剪。

碱基组成图中各位置 A/C/G/T 应大致平行；读段开头几位的波动常见于随机引物文库。N 的比例升高通常对应测序仪某个周期或某个区块的问题。

重复度用前 N 条读段估计（默认 10 万条），「去重后保留」越低说明重复越多；转录组与扩增子数据本来就有较多重复，判断时请结合实验类型。

接头图为「到该位置为止已出现接头片段的读段比例」，末端升高说明插入片段比读长短，建议先去接头再比对；也可用「FASTQ / FASTA 转换与抽样」做修剪和过滤。

方法说明

指标定义参照常用测序质控方法（Andrews 2010, FastQC；Chen et al. 2018, Bioinformatics 34:i884, fastp）；读段数、碱基数与 Q20/Q30 已与 fastp 对数一致，其余指标与独立 Python 参考实现逐项一致。

数据量

在浏览器中处理，未压缩 FASTQ 最大约 200 MB；文件较大时计算需要几十秒，请耐心等待。暂不支持直接读取 .gz 压缩文件。