GC 含量滑窗

上图是每个窗口的 GC 百分比，虚线为整条序列的 GC%；GC 明显偏离平均的区段可能是外源插入（如前噬菌体、基因岛）、rRNA 操纵子或测序/组装问题。

下图的 GC skew = (G − C)/(G + C)。细菌基因组中，前导链 G 多于 C，skew 在复制起点处由负转正、在终点处由正转负；累计 skew 的最低点、最高点常分别对应复制起点和终点。

窗口越大曲线越平滑、越小越能看到局部细节；步长决定点的密度。数据表给出每个窗口的起止坐标（1 起）。

GC% 只按 A/C/G/T 计算，N 等模糊碱基不进分母。

方法说明

GC skew 与累计 skew：Lobry 1996（Mol Biol Evol 13:660）；Grigoriev 1998（Nucleic Acids Res 26:2286）。

数据量

最多 20,000 个窗口；完整细菌基因组请把步长设为 1 kb 以上。