基因长度计算

有效长度 = 该基因所有转录本外显子合并后的总碱基数：重叠的外显子只算一次，内含子不算。这是计数类定量（按基因计 reads）后计算 TPM、FPKM 时常用的基因长度。

详细表另给出合并后的外显子块数、最长转录本长度、基因跨度（含内含子）与长度依据；细菌注释通常只有 CDS，会自动改用 CDS 并集。

第二张图是有效长度占基因跨度的比例：内含子多、长的基因比例低，单外显子基因接近 1。

两列的简表可下载后与计数矩阵按基因 ID 对接；按基因名对接时请注意重名。

方法说明

外显子并集长度（如 featureCounts 输出的 Length 列的定义，Liao et al. 2014, Bioinformatics 30:923）；已与独立 Python 参考实现及 bedtools merge 按基因求和交叉核对一致。

数据量

在浏览器中处理；建议注释文件不超过约 100 MB（约 30 万行）。完整的人类 GTF（解压后约 1.5 GB）请先按染色体或所需基因提取子集再上传。