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热图 / 点棒热图

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怎么读

点棒热图

每行是一个变量(如基因):右侧点棒表示指标大小与方向(如 log2FC,正值与负值用不同颜色),点越大表示点大小列越大(默认 −log10 校正 P,越大越显著)。

左侧热图显示同一变量在各样本或各组中的数值,用来检查指标是否由所有重复一致支持,而不是个别样本驱动。

热图默认按行 z 分数着色(只比较同一行在不同列之间的高低),颜色截断在 ±2;行默认按指标从大到小排列。

适合展示一组候选基因、特征重要性(如 VIP 值)或富集结果,并同时给出跨样本的变化趋势。

方法说明

z 分数使用样本标准差(n − 1);点半径与点大小值的平方根成正比;聚类为欧氏距离、平均连锁;原值发散色以 |值| 的第 95 百分位为两端,超出部分按端色显示。

数据量

最多显示 300 行。

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