MA 图

每个点是一个基因：横轴为平均表达量（取对数），纵轴为 log2 倍数变化；虚线为 ±|log2FC| 阈值。

MA 图用来检查差异结果是否依赖表达量：低表达基因的倍数变化通常波动更大（左侧呈喇叭口），若高表达区整体偏离 0，可能提示标准化问题。

红色为上调、蓝色为下调（同时满足校正 P 与倍数阈值），灰色为不显著；阈值请与方法部分保持一致。

DESeq2 的 baseMean 请用 log2(x + 1)；limma 的 AveExpr 或 edgeR 的 logCPM 已是对数尺度，请选「不变换」。

方法说明

Dudoit 等 (2002) Stat Sin 12:111（MA 图）；Love, Huber & Anders (2014) Genome Biol 15:550（DESeq2 baseMean）。作图不重新计算差异，只展示您结果表中的数值。

数据量

最多 200,000 个基因。