多序列比对

渐进式比对先按 k-mer 距离建一棵指导树，再沿树由近到远逐步把序列和已比对的组对齐；适合几十条、长度几千以内的同源序列。

着色视图中，相同或性质相近的残基颜色一致，下方保守度条越高表示该列越一致；可左右滚动查看全长。

Clustal 格式文本的保守性标记：「*」全部相同，「:」属于性质很相近的一组氨基酸，「.」属于性质较相近的一组，空格表示不保守或含缺口。

比对质量取决于序列的相似程度：一致性低于约 25% 的蛋白，比对可靠性明显下降。用于建树时，可把 FASTA 结果交给「进化树（NJ）」工具。

方法说明

渐进式比对框架：Feng & Doolittle 1987（J Mol Evol 25:351）；k-mer 距离：Edgar 2004（Nucleic Acids Res 32:1792）；保守性分组沿用 Clustal（Thompson et al. 1994, Nucleic Acids Res 22:4673）。

数据量

最多 50 条、每条 2,000 nt/aa 以内；更大的比对请联系我们做服务器端分析。