集合与关系 / 网络图
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圆点是节点、线是边;节点大小默认按度(连接的边数),边的粗细按 |权重|,负权重的边画成蓝色。布局为力导向:连接紧密的节点会聚在一起,可以拖动节点调整。
默认按 Louvain 社区着色:社区内部的连接明显多于随机预期;模块度 Q 越大(一般 > 0.3)说明社区结构越清楚。
有向网络画箭头,节点表另外给出入度与出度;社区划分始终按无向、|权重| 计算。
边很多时图会变成一团:先用「|权重| ≥」阈值筛掉弱边(如 |r| ≥ 0.6),或限制最多边数。节点表与边表可以下载后在其他软件里继续分析。
社区划分:Louvain 方法(Blondel V. D. et al. 2008, J Stat Mech P10008),按输入顺序遍历节点、结果确定;模块度 Q(Newman 2006, PNAS 103:8577–8582)。布局:Fruchterman–Reingold 力导向(固定随机种子)。
作图最多 5,000 条边、3,000 个节点。