O2PLS 分析

O2PLS 把两份按样本配对的数据（如转录组与代谢组）的变异拆成三部分：两者共有的「联合」变异、只属于 X 的特有变异、只属于 Y 的特有变异。联合 R² 越大，两组学共享的信号越多；「由 X 预测 Y 的 R²」反映用 X 的联合成分能解释多少 Y。

得分图中每个点是一个样本（X 的联合得分），载荷图中每个点是一个变量：X 与 Y 的变量落在同一方向，说明它们通过联合成分相互关联；离原点越远贡献越大。

成分数需要您指定：本工具实现的是不含交叉验证的简化 O2PLS，联合成分数一般取 1–3，特有成分数取 0–2；成分过多会过拟合。变量量纲不同时请保持「变量标准化」勾选。

含缺失值的变量会被去除；常数变量会被忽略。样本按名称配对，只用两份表都有的样本。

方法说明

Trygg J. & Wold S. (2003) Journal of Chemometrics 17:53–64；算法步骤参照 Bouhaddani S. el 等 (2018) BMC Bioinformatics 19:24 的 OmicsPLS o2m（不含交叉验证）。

数据量

每份表最多 5,000 个样本。