微生物与多组学 / 稀释曲线
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每条曲线是一个样本:横轴为随机抽取的读数,纵轴为在该深度下期望观测到的物种数。曲线末端越平,说明再增加测序深度也很难发现新物种,测序已基本饱和。
曲线由超几何公式精确计算,不涉及随机抽样,所以每次结果相同。竖虚线标出最小样本的读数,常用作抽平深度的参考:在该深度处各曲线大多已变平,说明抽平损失不大。
给出样本分组表时曲线按组着色;勾选「显示 ±1 标准误带」可看到每个深度下期望值的不确定性(样本数多时会比较拥挤)。
Hurlbert S. H. (1971) Ecology 52:577–586;Heck K. L. 等 (1975) Ecology 56:1459–1461。与 R vegan rarefy(se = TRUE)的公式一致。
最多 20,000 个物种;物种很多时标准误计算较慢。