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序列工具 / 序列格式化

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怎么读

序列格式化

把来源不一的 FASTA 整理成统一格式:固定每行字符数、统一大小写、规范标题行,并可按序列或 ID 去重。

「只保留 ID」去掉第一个空格之后的描述;「特殊字符换成 _」适合交给对 ID 有限制的软件(如建树软件);「重命名」会把原 ID 写进描述,便于回查。

按序列去重时不区分大小写,保留第一次出现的那条,被去掉的记录及其「重复于」哪条列在下表中。

处理顺序:去非字母字符 → 去 gap → 大小写 → 去空序列 → 去重。

方法说明

FASTA 格式(Pearson & Lipman 1988, PNAS 85:2444)。

数据量

在浏览器中处理,建议不超过约 100 MB 序列。

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