序列 LOGO

每一列对应一个位置，字母堆的总高度是该位置的信息量（bits）：DNA 最高 2 bits、蛋白最高约 4.32 bits，越高越保守；每个字母的高度与其频率成正比，最常见的在最上面。

纵轴改为「频率」时，每列高度都是 1，只看各字母比例，适合比较组成而非保守性。

信息量 = log2(字母数) − 香农熵。序列条数少时熵会被低估，表中可给出小样本校正后的值；图中字母高度按观测频率绘制、未作校正。

输入须为等长、已对齐的位点（如以起始密码子或转录起点对齐）；共有序列中大写表示 ≥1 bit 的保守位置。

方法说明

序列 LOGO：Schneider & Stephens 1990（Nucleic Acids Res 18:6097）；小样本校正同 Crooks et al. 2004（WebLogo, Genome Res 14:1188）。

数据量

最多 300 个位置。