VCF 转表格

每个位点输出一行（长表时每个样本一行），列依次为固定列、INFO 字段、注释拆分列与样本字段；宽表的样本列命名为「样本名:字段」。

取值与 bcftools query 相同：缺失值与未出现的 Flag 写作 “.”，出现的 Flag 写作 1；多值字段（如 DP4、AD）保留逗号分隔的原文。

勾选「拆分 ANN/EFF 注释」时，把功能注释的第一条拆成等位、注释类型、影响程度、基因名、HGVS 等列，适合直接筛选错义或高影响变异。

下载的 CSV 可直接用 Excel 打开，或继续用本站的表格筛选、分组汇总工具处理。

方法说明

字段取值对齐 bcftools query（Danecek et al. 2021, GigaScience 10:giab008），已逐格对数一致；ANN 字段按 SnpEff 注释格式规范拆分（Cingolani et al. 2012, Fly 6:80）。

数据量

在浏览器中处理，建议不超过约 100 MB 的未压缩 VCF。