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热图 / 环状热图

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怎么读

环状热图

每个扇区是一行(如一个基因),从内到外的每一圈是一列(样本),颜色表示数值高低;第一列在最内圈,列名标在 12 点方向的缝隙里。

打开「行 z 分数」时比较的是同一行在不同列之间的相对高低,不同行之间的绝对水平不可比;颜色默认截断在 ±2。

行聚类按欧氏距离、平均连锁排序,把模式相似的行排在相邻位置;排列只为便于观察,不是统计检验。

环形布局适合几十到一百多行、列数不多(2–12)的矩阵;行很多时标签会变小,建议先筛选。

方法说明

z 分数使用样本标准差(n − 1);聚类为欧氏距离、平均连锁(UPGMA)。

数据量

最多显示 400 行。

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