功能富集 / COG / KOG 分类图
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COG(原核)与 KOG(真核)把直系同源蛋白分到 26 个功能类别,每个类别用一个字母表示,再归入信息存储与处理、细胞过程与信号、代谢、功能不明确四大类。
每根条是该类别下的基因数;一个基因若属于多个字母(如 EH)或多个 COG,在每个相关类别各计一次,但同一类别内只计一次。
有分组列(如不同菌株、上调 / 下调基因)时画成分组条形,可改为「占该组有类别基因的百分比」以比较大小不同的基因集。
R、S 两类功能不明确,通常占比较高;需要时可隐藏。类别名称取自 NCBI COG 2020 的官方定义(英式拼写)。
Galperin M. Y. 等 (2021) Nucleic Acids Res 49:D274–D281(COG 2020);Tatusov R. L. 等 (2003) BMC Bioinformatics 4:41(COG / KOG)。百分比 = 类别基因数 / 该组有任一类别的基因数 × 100。