序列工具 / 序列截取 / 提取
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「按 ID 列表」从文件中挑出列表里的序列;「按坐标」从序列中截取区段;两者可组合:先挑序列再截取。
坐标从 1 开始、包含两端,与基因组浏览器和 GFF 一致;BED 文件是 0 起、左闭右开,使用前请把起点加 1。
标注 (-) 的区段输出反向互补序列(按 IUPAC 规则互补),结果 ID 记为「原 ID:起-止(-)」。
没找到的 ID、越界坐标会在黄色提示里列出;结果可复制或下载为 FASTA,清单表记录每条结果的来源与坐标。
坐标约定:1 起闭区间(GFF3 规范,Sequence Ontology);反向互补按 IUPAC-IUB 核酸代码(Cornish-Bowden 1985)。
在浏览器中处理,建议不超过约 100 MB 序列。