物种关系 Circos 图

圈图一侧是丰度最高的若干分类单元，另一侧是样本分组；连接带的宽度表示该分类单元在该组中的丰度，所以一眼可以看出哪些物种主要来自哪些组、各组的优势物种是什么。

默认数值为组内平均相对丰度：先把每个样本换算为百分比，再在组内取平均，因此各组的总和都是 100%，不受样本数和测序深度的影响；选择「组内读数合计」时，样本多、测序深的组会显得更大。

分类单元按各组平均值排序取前 N 个，其余可合并为「其他」。给出分类注释列时可以合并到属或门水平展示。也可以改用桑基图展示同样的数据。

方法说明

相对丰度 = 样本内读数 / 样本总读数 × 100；组内取算术平均。弦图布局参照 Krzywinski M. 等 (2009) Genome Research 19:1639–1645。

数据量

最多 50,000 个物种；图中最多 40 个分类单元。